7 ноября 2007 года авиакомпания «Газпромавиа» открыла полеты в Томск из аэропорта Внуково. Первый рейс состоялся в день празднования 40-летия аэропорта «Томск» (Богашево). Регулярные рейсы на данном направлении будут выполняться по средам и воскресеньям на самолетах Ту-154М в двухклассной компоновке (бизнес- и экономкласс). Вылет из аэропорта Внуково в 09:30, прилет в Томск в 16:30 местного времени. Вылет из Томска в 17:55, прибытие во Внуково в 18:55 мск.

Первым пассажиром, зарегистрировавшимся на рейс Москва – Томск, стала жительница Минска Ирина Кобозева. Ей были вручены памятные сувениры от аэропорта Внуково, от авиакомпании «Газпромавиа» – сертификат на бесплатный перелет по маршруту Москва – Томск – Москва, которым можно будет воспользоваться до 31 декабря 2008 года.

По прибытии в Томск в аэропорту состоялась торжественная встреча первого рейса. В мероприятии приняли участие представители областной администрации, авиакомпании «Газпромавиа», аэропортов «Томск» (Богашево) и Внуково, а также средств массовой информации. По случаю открытия нового авиарейса и юбилея аэропорта состоялась пресс-конференция, на которой отмечалось, что Томск является стратегически важным пунктом в развитии маршрутной сети «Газпромавиа». В ближайшей перспективе авиакомпания планирует использовать на данном маршруте лайнер нового поколения Boing 737-700.

В этот день поздравления звучали и в адрес пассажиров, вылетавших первым рейсом «Газпромавиа» Томск – Москва. Памятные подарки от аэропорта Внуково и сертификат на бесплатный перелет в направлении Томск – Москва – Томск получил Анатолий Титов, который первым прошел регистрацию на данный рейс.

ООО «Авиапредприятие «Газпромавиа» – 100% дочернее общество ОАО «Газпром», является крупнейшей отечественной корпоративной авиакомпанией. Парк воздушных судов «Газпромавиа» насчитывает 39 воздушных судов и 89 вертолетов.